一、無菌室要求:無菌室、潔淨室是微生物檢測的重要場所基本的設施。它是微生物檢測質量保證的重要物質基礎。因此它的設計要按國家標準-2001《潔淨廠房設計規範》、國家藥品監督管理局頒發的《藥 品檢驗所實驗室質量管理規範（試行）》中第十八條規定執行。微生物實驗室潔淨室的施工、安裝、驗收應按國家行業標準JGJ71-1990《潔淨室的施工及驗收規範》執行。對於微生物檢測工作者和使用管理者來講，更大量的工作是進行正常管理到日常的使用。
二、 無菌室、潔淨室的標準要符合GMP潔淨度標準要求。無菌室一般是在微生物實驗室內專辟一個小房間。可以用板材和玻璃建造。麵積不宜過大，約 4 — 5 平方米即可，高 2.5 米左右。無菌室外要設一個緩衝間，緩衝間的門和無菌室的門不要朝向同一方向，以免氣流帶進雜菌。無菌室和緩衝間都必須密閉。室內裝備的換氣設備必須有空氣過濾裝置。
二、無菌室、潔淨室按用途可分二大類：
A、生物潔淨室，主要控製有生命微粒與無生命微粒對工作對象的汙染；而生物潔淨室又可分為：
1、 一般生物潔淨室，主要控製微生物對象的汙染。同時其內部材料要能經受各種菌劑侵蝕，內部一般保證正壓。實質上其內部材料要能經受各種去菌處理的工業潔淨室。例：製藥工業、醫院（手術室、無菌病房）食品、化妝品、飲料產品生產、動物實驗室、理化檢驗室、血站等。
2、 生物學潔淨室：主要控製工作對象的有生命微粒對外界和人的汙染。內部要保持與大氣的負壓。例：生物學、潔淨實驗室、物物工程（重組基因、疫苗製備）。
B、工業潔淨室——以無生命微粒的控製為對象。主要控製空氣塵埃微粒對工作對象的汙染，內部一般保持正壓狀態。 它適用於精密機械工業、電子工業（半導體、集成電路等）宇航工業、高純度化學工業、原子能工業、光磁產品工業（光盤、膠片、磁帶生產）LCD（液晶玻璃）、電腦硬盤、電腦磁頭生產等多行業。
三、無菌室要求：
1、無菌室要符合規範要求：無菌室應采光 良好、避免潮濕、遠離廁所及汙染區。麵積一般不超過10m2，不小於5m2；高度不超過2.4m。由1—2個緩衝間、操作間組成（操作間和緩衝間的門不應直對），操作間和緩衝間之間應具備去菌功能的樣品傳遞箱。在緩衝間內應有洗手盆、毛巾、無菌衣褲放置架及掛鉤、拖鞋等，不應放置培養箱和其他雜物；無菌室內應六麵光滑平整，能耐受清洗。牆壁與地麵、天花板連接處應呈凹弧形，無縫隙，不留死角。操作間內不應安裝下水道。
2、無菌室要求操作室應具有空氣過濾的單向流空氣裝置，操作區潔淨度100級或放置同等級彆的超淨工作臺，室內溫度控製18—26℃，相對濕度45%—65%。緩衝間及操作室內均應設置能達到空氣效果的紫外燈或其他適宜的清潔裝置，空氣潔淨級彆不同的相鄰房間之間的靜壓差應大於5Pa，潔淨室（區）與室外大氣的靜壓差大於10Pa。無菌室內的照明燈應嵌裝在天花板 內，室內光照應分布均勻，光照度不低於300lx。緩衝間和操作間所設置的紫外燈（2—2.5w/m3），應定期檢查輻射強度，要求在操作麵上達40uw/m2。不符合要求的紫外燈應及時更換。
3、建立使用登記製度：各個微生物檢測檢驗室都要建立使用登記製度。在登記冊中可設置以下項目內容：如使用日期、時間、使用人、設備運行狀況、溫度、濕度、潔淨度狀態、報修原因、報修結果、清潔工作（臺麵、地麵、牆麵、天花板、傳遞窗、門把手名稱等。
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